Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms