Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA3Q08378 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA3Q08378 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms