Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNB2Q08289 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNB2Q08289 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms