Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms