Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms