Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPCQ01831 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms