Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms