Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms