Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms