Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms