Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms