Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms