Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RORCP51449 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORCP51449 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms