Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms