Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms