Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms