Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms