Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC27P30260 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC27P30260 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC27P30260 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC27P30260 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC27P30260 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms