Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms