Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms