Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms