Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XPAP23025 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XPAP23025 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XPAP23025 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XPAP23025 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XPAP23025 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms