Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CXCL2P19875 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CXCL2P19875 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CXCL2P19875 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CXCL2P19875 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL2P19875 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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