Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms