Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN8P19075 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms