Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms