Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms