Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms