Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms