Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOP08100 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOP08100 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms