Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCATP04180 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCATP04180 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCATP04180 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms