Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFL1O94874 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFL1O94874 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFL1O94874 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFL1O94874 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFL1O94874 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms