Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms