Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA10O75578 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms