Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSPNO60542 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSPNO60542 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSPNO60542 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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