Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3LO60238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms