Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms