Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms