Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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