Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms