Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms