Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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