Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS8O00217 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS8O00217 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms