Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms