Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-2B6SEH9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms