Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms