Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A8MVJ9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A8MVJ9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A8MVJ9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MVJ9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms