Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms