Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FARSAQ9Y285 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms