Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms